Намира се на 5-тия етаж на болницата и в него работят специалисти с дългогодишен опит в диагностиката и лечението на: болести на хранопровода, на стомаха и дванадесетопръстника, на тънките и дебелите черва, на черния дроб, на жлъчния мехур и жлъчните пътища, на панкреаса. В отделението има съвременна ендоскопска апаратура /видеофиброгастроскоп, видеофибродуоденоскоп, видеофиброколоноскоп. Извършва се горна ендоскопия /фиброезофагогастродуоденоскопия с биопсия,долна ендоскопия /ректоманоскопия с биопсия/. Интервенционната горна и долна диагностика и терапевтична гастроинтестинална ендоскопия –съвременни УЗ апарати с възможност за Доплер ехография /ултразвукова коремна диагностика ,Доплерова сонография ,сонография на щитовидната жлеза /.