Всички заплати на всички служители – от санитарите до директора на „Пирогов”  -
се формират както във всяко търговско дружество – плаща се за реално извършена дейност. Това се казва в съобщение на пресцентъра на лечебното заведение в отговор на появили се твърдения за високи възнаграждения на ръководството и на лекари.

Средната заплата в болницата за 2009 г. е била 962,50 лева. Съгласно заповед на министъра на здравеопазването, възнагражденията на изпълнителните директори в държавните болници се формира на база четири средни брутни работни заплати на съответното лечебно заведение. "Така е и в „Пирогов”. Средната заплата, която зависи от постигнатите икономически резултати, варира всеки месец"- се посочва в съобщението до медиите.

Пресцентърът определя като невярна и информацията за заделени
60 хил. лева за банкет, посочвайки, че през 2009 г. не е даден и лев за празненства.